谷歌云托管由自闭症研究人员上传的1,000个基因组,通过数据存储推进科学研究

谷歌云托管由自闭症研究人员上传的1,000个基因组,通过数据存储推进科学研究

谷歌云托管由自闭症研究人员上传的1,000个基因组,通过数据存储推进科学研究

Autism
一名自闭症儿童在约旦安曼戴着面具。 一个新项目将自闭症谱系中的人的基因组上传到谷歌云,以帮助研究人员努力推进对这种疾病的治疗。 照片:Ali Jarekji /路透社

科学家正在利用谷歌和其他公司提供的云服务来简化和分享人类基因组测序产生的大量数据。 希望云服务的功能和速度的提高将加速研究并增加医学和其他领域的进步机会。

例如,作为由非营利组织Autism Speaks赞助的新项目的一部分,星期一将一千个属于自闭症谱系的人的基因组上传到谷歌的服务器。

数据转储代表10,000个基因组中的第一个,这些基因组最终将存储在公司的云中并在自闭症专家中共享。 该项目的资助者,即 ,希望研究人员能够利用基因组的宝库来进行早期诊断,开发针对性治疗,甚至找到治疗这种被认为具有遗传的疾病的方法。

Mssng是一系列基于基因组的项目中的最新项目,这些项目使用云存储技术来推动科学发展。 通过这些举措,云存储技术已被证明对公司和科学家来说都是一个福音。 国际数据公司的 ,全球范围内,云服务构成了457亿美元的产业。谷歌通过创建平台,允许轻松上传,存储和共享基因组数据以及快速和工具,对研究人员表示欢迎。分析。

云存储已用于其他基因组研究。 其中一个项目名为 ,由Baylor College of Medicine与亚马逊和一家名为DNAnexus的公司共同运营。 该项目导致3,751个基因组被分析用于研究心脏病和衰老。 在类似的合资企业中,IBM和纽约基因组中心最近以利用Watson的智能计算软件进行基因组研究。

Mssng首次将自闭症基因组上传到谷歌也是自然医学周一发表的一项研究的一部分,该研究分析了兄弟姐妹的基因组,寻找关于遗传学如何影响疾病发展的线索。 根据Autism Speaks提供的 ,结果显示,既有自闭症的兄弟姐妹也不一定与父母共享相同的自闭症相关基因。 研究人员已经知道患有自闭症的孩子的父母更有可能 ,甚至并不总是表现出相同类型的自闭症。

Mssng的开发人员希望这一新数据与基于云的分析工具相结合,将有助于研究人员更多地了解自闭症的可遗传性,这可以影响美国68名儿童中的一人,根据Autism Speaks首席科学官Robert Ring撰写 ,当项目宣布时。

谷歌可能在进一步进行基因组研究方面拥有其他兴趣。 据圣何塞水星报报道,两年前,它开办了一家名为Calico的医疗保健公司,该公司正与药物公司AbbVie合作,在旧金山湾区 ,以寻求延长寿命的方法。 该团队可以寻找工程师或修复部分基因组的解决方案。 去年,该公司加入了Merck&Co。和Amgen,成为成员,该致力于开发基因组学医学。

自20世纪70年代后期DNA测序技术成为可能以来,基因组数据一直备受推崇。 2003年, 为遗传学家提供了人类内存在的所有遗传多样性的图谱。 ,在早期对基因组进行测序可能需要花费10万美元。 此后成本降低 - 每个基因组大约5000美元 - 并引发了该领域内的大量数据爆炸。 过去,服务器容量和分析工具限制了这些数据的使用或共享量。

“最初,我们通过在全球范围内运送硬盘来共享基因组信息,”Ring在他的博客文章中写道,“以传统方式下载一个人的整个基因组可能需要数小时 - 相当于下载一百部故事片。”

通过Google新的开放式访问数据库应该允许尚未对基因组进行测序的研究人员跳过这一步骤,直接进行分析,并帮助那些不必担心技术细节并专注于他们科学的人。 所有条目在上传到数据库之前都会被删除名称等标识信息。

“研究人员花费更少的时间来移动数据,花更多的时间分析数据并与同事协作,”Ring写道,“我们希望这能使我们能够比以往更快地发现并推动创新。”


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